故事延續第一季,原始反應堆計劃在上京市遭到王一飛等人的破壞后,丁思聰漁翁得理成功接管盤古集團,進展卻并沒有如他想象一般簡單。王一飛被神秘的黑甲武士掠走,去向不明。在一切看似已經平息的時候,一場更為恐怖的浩劫正在這座城市上空醞,與此同時,來自南海邊陲的除魔少女唐尋嫣帶著她的守護者燕青,踏上了這片是非之地。盤古少爺丁思聰接管集團后,為挽救家族企業,銳意開發并推出VR游戲,一時大賣,不料好景不長,白天看似平靜的上京市,一到夜晚,竟變成課人人自危的,神秘反派利用方石的黑暗之力,異化無辜市民,化身不明生物,晝伏夜出,獵殺一切所見之物。唐尋嫣和她的守護者燕青力圖挽救危局,徹查不明物種源頭。丁思聰和織田信長面對內憂外患,選擇抗爭到底。